移动厕所不像传统的公共厕所一样，移动厕所没有固定的污水处理通道，一般常见的移动厕所的类型大致可以分为以下几种：
水冲与无水冲抽吸式移动厕所
水冲式移动厕所内有水冲装置，一般将水箱置于厕所顶部，厕所底部设置有污水箱，而无水冲式移动厕所则没有冲水装置，由设置于厕所底部的污水箱直接承接使用人员的排泄物。由于这两种形式的移动厕所污水箱容量较小，当使用到规定人数时，需要及时抽吸，否则容易发生满溢事件，抽吸频率较高。
循环水冲型移动厕所
该种移动厕所配置有间歇式好氧与厌氧处理粪便污水装置，另再添加生物菌种，运用生物膜技术，加速粪便污水的发酵分解，然后通过过滤装置，将经处理的粪便污水再循环用于冲洗厕所洁具，其特点是运用了先进的粪便污水处理技术，节约宝贵的水资源，减少粪便污水抽吸次数，环保理念得到充分彰显。
干式打包型移动厕所
该种移动厕所没有水冲装置，排泄物由放置于洁具下部的可降解塑料袋承接，每使用一人次，自动换置另一新的塑料袋，用完后将塑料袋集中收集运往处理厂处置。这种移动厕所的特点是完全不用水冲，节约水资源，污物收集比较方便。
泡沫封堵型移动厕所
泡沫封堵型移动厕所是利用发泡液混合液产生的泡沫代替厕所冲水，使用时，厕具侧壁上设有泡沫通道，泡沫厕所的压缩空气经压缩空气输送管至泡沫激发器，使泡沫箱发出的泡沫经泡沫通道覆盖便器内侧而无臭味，使用泡沫代替水冲厕具，此系统紧靠收集净手水就可满足发泡用水，因此最大限度地节约水资源。
微生物型移动厕所
微生物型移动厕所排泄物通过自动开启便盆进入固液分离装置，该套装置可将小便过滤，将大便推开分离出来，然后分别进行处理。大便被分离后进入发酵槽，通过螺旋推进器转动将初期配料、木屑、生物菌种和粪便混合，在微生物菌的作用下分解，以CO2和H2O的形式分离，降解率≥99%；小便被过滤后进入小便综合处理系统，经曝气、蒸发、脱色等工序将其处理成中水回冲小便器，形成循环。
另外，一些移动厕所增加了自动化功能，投币后自动开门，使用完后自动冲洗洁具和地坪，装有应急呼叫装置和为残障人服务的设施，还有依靠太阳能供应能源的移动厕所，自带发电装置、设有空调设备的移动厕所等等，种类非常丰富。
